廷必须对于优免进行严格审计，同时统一度量，现在税赋征收混乱，亩、丁、两、石，各种征收的标准，导致整个赋税制度混乱不堪，必须要对于整个赋税的征收予以大改革，同时征收标准。
这点得到了朱载坖的认同，之前张居正就奏请过进行大规模的折银，用以赋税的征收模式，以方便朝廷的岁入岁出，但是之前朱载坖考虑到朝廷并没有掌握铸币权，大规模推行赋役的折色，会导致对于百姓的盘剥加重，所以朱载坖并没有同意张居正的这一建议。
但是现在，朝廷已经重新掌握了铸币权，若是能够控制倭国，然后对南洋施加影响的话，铸币问题可以得到解决，同时随着各地的常平仓、备荒仓的建设，朝廷可以利用这些仓储设施来调控粮价，防止出现谷贱伤农的情况，所以现在开始大规模的赋役折色，省并科则，对于大明的赋税制度进行大规模改革的条件已经成熟了。
在这点上，朱载坖和海瑞的看法是一致了，限制优免和税赋改革要同步进行，统一朝廷的收入，统一优免的标准，这些都是要同步进行的，不过此事不是这么简单的，海瑞也认为要深思熟虑之后再动手，切不可打草惊蛇，同时要有熟悉财政的人对于大明的赋役制度进行改革。
朱载坖先让海瑞去收集相关的材料，同时下达诏书，要求各地方官府与户部、都察院一道，查照嘉靖三十四年所制定的优免则例，严格各地的优免，不准冒滥优免，亦不准借优免逃避朝廷的赋税的赋税，各地的巡按御史在巡察的过程中要严厉查究优免冒滥的问题，对于士绅官员不但不承担自身的徭役，还通过诡寄、花分、寄庄等手段，隐蔽缺乏优免权的人户，攫取比法律规定的优免数额多得多的不法免除。
朱载坖命令都察院和地方官府要严厉查究治罪，同时对于优免资格，也要予以严格审核，朱载坖在诏书中明确指出，生员举子优免冒滥，要求对于生员的优免，严格按照洪武二年的规定执行，洪武二年的诏书规定：“京府学生员六十人，在外府学四十人，州学三十人，县学二十人，日给廪膳，听于民间选补，仍免其家差徭二丁。”
至于其他的生员，只免本人杂泛差役，纳银、纳粮取得的监生等功名不能优免。
朱载坖还给在荆州老家的张居正密旨，要求张居正将原本的一条鞭法予以改进，更加简洁，统一征收标准，将各种杂役等都折银编入田亩之中，实现以田亩征税，而非以人丁征税，其实就是将摊丁入亩和一条鞭法结合起来，同时优免则例也要相应的修改，以银两为优免的标准，这样便于统计，也便于朝廷