引起了许多人的不满，并最终引发了一场朝堂争斗。但只要皇帝不管，争议就只是争议。最后，申时行、张四维上疏乞休，皇帝不允，反倒是弹劾申时行及张四维的一干人等，该罚俸的罚俸，该降调的降调。
当然，也不是所有阁臣的儿子都能在殿试上显名。只要过不了乡试、会试这两关，纵使当爹的位至首辅并被皇帝点为首席读卷官亦是无用。最现成的例子便是现任首辅方从哲的“好大儿”方世鸿。这位纵意情场，喜好狎妓的浪荡公子，就是典型的科举苦手。几十年下来，别说举人、进士，连个秀才的功名都混不上。好不容易靠着老爹的恩荫，混了个正六品的尚宝司司丞的闲差，还不争气地弄丢了。搞出来的动静，差点没把老爹拉下去。
除了阁相与皇帝，内相若是得势也能影响殿试。就比如正德三年，以时任首辅李东阳为首的读卷官们“曲意逢迎”如日中天的大太监刘瑾，接受指教，将刘瑾的同乡，会试第六名，陕西人吕柟点为状元。刘瑾希望以此招揽吕柟，但吕柟却一点儿也不领刘太监的情，坚决拒绝了刘瑾的招揽。他的行为毫不意外地引来了刘太监的敌视，不得不辞官保命，直到嘉靖朝才被重新启用。
不过即便吕柟没有投在刘瑾幕下，也还是招来了非议，因为当年，希望联捷的杨慎连会试都没过。所以就有人猜测是刘瑾和吕柟在背后捣鬼，影响了久负盛名的才子杨慎高中状元。得亏杨慎不是万历朝中后期参加科举，否则别说“久负盛名”了，不被言官弹劾得一身污泥都是好的。
担任首席读卷官的内阁首辅李东阳是他的老师，他的老爹杨廷和也是殿试读卷官，并且很有可能继任首辅，而作为皇帝的朱厚照又对科举排名没那么大的所谓。这种组合摆在“满朝悍臣”的万历朝就是给人弹的。至于能不能弹得动又是另外一回事了。
除开这些潜伏于政治胜败之下的暗黑潜规则，还有一些基于现实原因而不得不产生的灰白潜规则。
尽管殿试的考生数量比之千万人所共襄的会试要少得多。但相应的，阅卷时间也被压缩到了十六日这一天。要在这么短的时间内对每篇殿试文章一一评头论足，再分出高低好坏，实在困难。
为了尽快评出优卷，避免耽误殿试流程。殿试的受卷官往往会在弥封之前，按不成文的惯例，把会试前几名或者前十几名的试卷挑出来摆到一边。这是很容易的，因为大殿内哪个位子坐着哪个人都是清清楚楚、明明白白的事情。
如果不出意外的话，而且没有人提前打招呼，那么一甲前三名大概率会在这些试卷中产生，而剩